第 63 章 Stan入门

相比于传统的方法来说，Stan建模具有更好的可操作性、透明性和可解释性。本周开始，我们将开始学习贝叶斯数据分析，希望通过一些案例，让大家了解Stan的强大和价值。根据我有限的学习经验，采用code first 教学。

63.1 R4.1配置方法

• 安装 Rtools4.0到C盘

• 添加系统路径(电脑 - 属性 - 高级系统设置 - 环境变量 - 系统变量 - Path)

  • C:\rtools40
  • C:\rtools40\mingw64\bin
  • C:\rtools40\usr\bin

• 配置

writeLines('PATH="${RTOOLS40_HOME}\\usr\\bin;${PATH}"', con = "~/.Renviron")

• 安装rstan宏包

remove.packages(c("rstan", "StanHeaders"))
install.packages("rstan", repos = c("https://mc-stan.org/r-packages/", getOption("repos")))
install.packages(c("tidybayes", "bayesplot"))

63.2 R4.2配置方法

• 安装 Rtools42到C盘，推荐使用它默认的路径

• 安装rstan宏包

remove.packages(c("rstan", "StanHeaders"))
install.packages(c("rstan", "StanHeaders"), repos = c("https://mc-stan.org/r-packages/", getOption("repos")))
install.packages(c("tidybayes", "bayesplot"))

63.3 遇到问题，请参考

• https://mc-stan.org/r-packages/
• https://github.com/stan-dev/rstan/wiki/RStan-Getting-Started