Capítulo 5 Manejo de la biblioteca y gestión de paquetes

La versión básica del software R trae una cantidad limitada de herramientas para análisis estadístico. Como generalmente buscaremos usar otras funcionalidades, se vuelve necesario descargar nuevos paquetes y saber cómo cargarlos en la sesión de trabajo.

5.1 Descargar paquetes

La descarga e instalación de paquetes adicionales a la versión básica de R se realiza mediante el comando install.packages() indicando entre comillas el nombre del paquete a descargar. Este comando conecta la sesión de R directamente con el CRAN y descarga al computador - en la carpeta de instalación de R - los paquetes requeridos. Por ello, se requiere tener conexión a Internet para efectuar tal operación. En el siguiente ejemplo se descarga el paquete readxl que permite abrir bases de datos desde formato Excel en la sesión de R.

Ejercicio 5.1

install.packages("readxl") #Se descarga e instala el paquete readxl.

Una vez ejecutado tal comando saldrán distintos mensajes en la consola de R, generalmente con una apariencia como la que se muestra en la imagen a continuación. Vale destacar que muchas veces salen mensajes en rojo e incluso mensajes de alerta (warnings); por lo general se trata de mensajes que el programa muestra al usuario, pero que no implican que algo haya salido mal en la ejecución del comando. Como se aprecia en la siguiente imagen, el software indica cuándo el paquete se descargó e instaló de manera adecuada en el computador, a la vez que la consola queda lista para seguir ejecutando análisis.

Imagen 5.1: Consola indicando instalación exitosa del paquete readxl

5.2 Cargar paquetes

Ya se ha indicado que R funciona en la memoria temporal del programa (memoria RAM). Esto hace que cada vez que se abre el programa (vía RStudio) éste se despliega en su versión básica. Es por ello que no basta con descargar al disco duro los paquetes para poder utilizarlos. Para usar una función correspondiente a un paquete adicional a la versión básica de R tal paquete se debe cargar en la sesión de R en que se está trabajando.¹³ Esto se efectúa con el comando library() indicando entre paréntesis el nombre del paquete a cargar. A diferencia de la función install.packages acá el nombre del paquete no se indica entre comillas.

Ejercicio 5.2

library(readxl) #Carga el paquete descargado a la sesión de trabajo de R.

Como se observa en la imagen a continuación, en esta operación el software también puede arrojar mensajes en rojo que no significan que haya ocurrido un error. En este caso es un mensaje de alerta para el usuario (Warning message) que informa que el paquete “fue construido para una versión del software menor a la 3.4.4”.

Imagen 5.2: Consola indicando mensajes de alerta al cargar un paquete

5.3 Actualizar la versión básica de R y los paquetes instalados

R está en permanente actualización por lo que luego de algunos meses la versión que haya sido instalada quedará desactualizada. Cada versión busca introducir mejoras, robustecer funciones ya existentes, etc.

Si se precisa actualizar la versión instalada del software una primera opción es repetir las operaciones indicadas en el capítulo 3. No obstante, es posible efectuar una actualización del software mediante la función updateR(). Esta función es parte del paquete installr y funciona solamente para el sistema operativo Windows. Como se observa en las siguientes líneas de comando, se trata de un procedimiento simple.

Ejercicio 5.3

install.packages("installr")

library(installr)

updateR()

Los diversos paquetes existentes para R son desarrollados a lo largo del mundo por una extensa red de colaboradores. Cuando estos paquetes superan su período de prueba son enviados al R Core Team (equipo a cargo de mantener y mejorar el software en sus diferentes versiones) donde son testeados y luego subidos de manera oficial al CRAN. Así como el software R, estos paquetes están sujetos a permanentes actualizaciones y mejoras. Por ello, también es preciso conocer alguna forma de actualizar de manera rápida y simultánea todos los paquetes que estén instalados en el disco duro. Para ello, se sugiere utilizar el siguiente comando.

Ejercicio 5.4

update.packages()

No es necesario ejecutar el comando install.packages cada vez que se requiera usar un paquete adicional a la versión básica de R. Basta con hacerlo una sola vez pues los paquetes se descargan al disco duro del computador, quedando almacenados allí. Lo que se precisa es cargarlos en la sesión temporal de R cada vez que se abra una sesión nueva donde no hayan sido cargados previamente.↩