Capítulo 9 Aplicaciones en Biología

Proyecto

Realizar las unidades teóricas con las siguientes lecturas:

tidy genomics: https://rpubs.com/jp_6/778522

tidy bioinformatics: https://rpubs.com/jp_6/783214

Después, aplicar las herramientas de R con sus muchas librerías, RStudio y la suite de tidytranscriptomics para obtener conocimientos sobre la biología de la actividad genética y la dirección bioinformática para responder una pregunta biológica dada una base de datos. La expresión genética brinda información valiosa sobre el funcionamiento de las células en determinadas condiciones. Especialmente cuando se comparan, por ejemplo, muestras sanas y enfermas, puede quedar claro qué genes son causales o están bajo la influencia de una condición específica. Así, la actividad de encontrar los genes de interés (genes que muestran una expresión diferente en diferentes condiciones) es normalmente conocida como expresión diferencial genética.

tidy RNA-seq: https://rpubs.com/jp_6/792462

La producción final deberá poder compartirse vía una liga en RPubs/shinyapps.

Ejemplo de producción en shiny:

circular plots: https://juan-pablo-acua-gonzlez.shinyapps.io/gen_browser/, https://juan-pablo-acua-gonzlez.shinyapps.io/phy4/