Chapter 5 Rmarkdown

Rmarkdown 문서 작성법과 임베딩에 대해 이야기 하겠습니다. Rmarkdwon 문서가 처음이 신 분은 아래의 DsPub 기본 강의록 참고 (하단) 또는 https://bookdown.org/jinhaslab/testing/ 의 쳅터 16을 보시기 바랍니다.

5.1 DsPub 기본 강의록 참고

R마크다운은 마크다운을 R에서 사용하기 쉽게 한 프로그램입니다. 마크다운은 자주 사용되는 문서 형태로, 기존의 문서 보다는 웹, 상호작용, 표, 그림 등에서 더 유용합니다. 데이터과학에서 상화 협업을 위해서 마크다운은 자주 사용되는 문서 형태입니다.

마크다운은 https://rmarkdown.rstudio.com 에서 tutorial 을 30분 정도 해보시는 것을 추천합니다. 본 쳅터에서는 가장 기본 적인 것을 위주로 설명하겠습니다.

마크다운 안내	내용
rstudio.com	https://rmarkdown.rstudio.com
lecture 1

설치는 다른 페키지 설치와 같습니다. 아래의 install.packages()명령을 통해 설치해 봅니다 .

install.packages("rmarkdown")

그리고 Cheatsheet을 이용하여 공부하면 됩니다. 다시 말하지만, 외우기 보다는 필요한 내용만 그때 그때 사용하시는 것을 권장합니다.

R마크다운은 3가지 요소로 구성됩니다. 하나는 YAML, Text, 그리고 Code 입니다.

기본 세팅을 하게 됩니다. 제목과 html_document 방식 출력을 해보겠습니다. 문장, 그리고 plot을 해보겠습니다.

아래와 같은 코딩으로 상기 화면이 출력됩니다.

markdown tutor 1

즉 글을 쓰고, chunck를 만들고 그 안에 R code를 적으면 됩니다. chunck 는 crtrl + alt + i를 사용하면 생성됩니다.

chunck 에 몇가지 옵션을 설정할 수 있습니다. 이는 r{ } 의 괄호 안에 넣으면 됩니다.

표를 만들기 위해서는 code를 이용하는 방법과 Text를 이용하는 방법이 있습니다. code는 data.fram을 출력하는 방식입니다.

fruit<-data.frame("fruit" = c("apple", "orange", "mango"), 
                  "taste" = c("delicious", "lovely", "Wow!"))
DT::datatable(fruit)

Text방식은 |를 이용하는 것입니다.

table rmarkdown

마크다운은 설명하기가 쉽지 않네요! 반드시 아래 홈페이지를 들어가서 보시기 바랍니다.

마크다운 안내	내용
rstudio.com	https://rmarkdown.rstudio.com
lecture 1

글로 설명하기 어렵네요, 아래의 동영상을 보고 해보세요!

rmd 를 쓰는 이유중 하나는 여러 언어를 같은 곳에서 사용할 수 있기 편리하다는 것입니다. 예를 들어 파이썬 을 사용하는 것을 보겠습니다.

if (!require(reticulate)) install.packages('reticulate')

## Loading required package: reticulate

library(reticulate)

# if that ask install of miniconda, click yes to install
# installed path in user dir
x= 'hello, dspub is open'
print(x.split())

## ['hello,', 'dspub', 'is', 'open']

문장을 쓰는 중에도 사용할 수있습니다.

rmarkdown

안녕하세요! R markdow 을 이용하여 자동 보고서를 만들어 보겠습니다.

iris 데이터는 총 150 줄이며, 항목은 Sepal.Length, Sepal.Width, Petal.Length, Petal.Width, Species 입니다.

## # A tibble: 3 x 2
##   Species      avg
## * <fct>      <dbl>
## 1 setosa      5.01
## 2 versicolor  5.94
## 3 virginica   6.59

보시다시피, setosa, versicolor, virginica 의 평균은 각각 5.006, 5.936, 6.588 입니다.