R aplicado à Biologia: uma introdução descomplicada e divertida!
Marcos Vital, do Laboratório de Ecologia Quantitativa da UFAL
Versão atualizada em 2017-01-07
Capítulo 1 - Sejam bem vindos!
Este material foi construído com a ajuda de muitas pessoas que acreditam no LEQ e em Ciência Livre. Muito obrigado!
Para mais material, visite o Cantinho do R
1.1 - Preparar, apontar… vai!
Um prefácio da nova apostila do Cantinho do R
Viva! Depois de uma longa demora (pelo menos para quem nos acompanha desde o começo), aqui está a nossa nova apostila do Cantinho do R! :D
Se você é um recém chegado, acho que eu tenho que começar explicando aqui o que é, pra que serve e de onde nasceu este material, não é? É disso que se trata este primeiro capítulo. Mas não se preocupe, não vou enrolar muito, e logo, logo começaremos a usar o R, beleza?
O que é e pra que serve este material?
Como o nome já sugere, este é um material introdutório para os pobres mortais que desejam, precisam ou são obrigados a usar o R, com um pé na Biologia (no que fiz respeito aos exemplos e aplicações). Ela foi feita pensando naquelas pessoas que estão começando: pode ser você que nunca usou o R na vida, você que já usou um pouquinho mais ainda precisa aprender um bocado ou ainda você que já arrancou muitos cabelos e roeu muitas unhas se estressando com ele. ;)
Uma coisa pra se ter em mente é que eu estou escrevendo este livro na forma de um livebook: ele pode (e deve!) ser atualizado de tempos em tempos, de forma que pode ser legal você conferir se está vendo a versão mais recente. Se quiser acompanhar os lançamentos de novas versões, atualizações e novos módulos (sim, este é apenas o primeiro!), dois caminhos legais são: seguir o blog Cantinho do R ou curtir a página do ]nosso laboratório lá no facebook](https://www.facebook.com/leq.ufal/).
E por que você criou isso?!
Então, galera, chega mais e me deixecontar uma coisa: bioestatística é o maior barato! Muito legal mesmo. E o R é super divertido de usar! :D
Sério!
Sério mesmo!! :D
Tá bom, vocês podem achar que eu estou brincando (ou, mais provável: que eu sou completamente doido), mas a minha missão é convencer vocês de que o que eu falei ali em cima é verdade. Ou, pelo menos, convencer vocês de que este tema - a Bioestatística - e esta ferramenta - o R - são coisas que você pode dominar, mesmo que não sejam coisas que você ache super legais e empolgantes. E sim, estou falando com você:
- você, que sempre sofreu com matemática;
- você, que quase teve um troço quando abriu o R pela primeira vez e viu aquele cursor piscando e te esperando escrever alguma coisa;
- e você, que foi para o curso de Ciências Biológicas (ou algum outro parecido) achando que nunca mais ia estudar matemática na vida, mas acabou quebrando a cara…
1.2 - De onde veio isso?
Um pouco sobre a história deste material
A semente deste material germinou quando eu me tornei professor aqui na UFAL, lááá no começo de 2010, e comecei a lecionar Bioestatística para o curso de graduação em Ciências Biológicas.
– Ah, Marcos, então você é Estatístico?
– Não.
– Matemático?
– Nope. Sou Biólogo, veja só!
Então vamos voltar só mais um pouquinho no tempo, beleza? Lá no comecinho da minha graduação, quando eu era ainda um nerd magricela tímido e cheio de espinhas na cara (hoje não tenho as espinhas, ufa!), eu me interessei bastante pela área de Ecologia. Ainda estava bem perdido no curso, e sofrendo o impacto de fazer disciplinas com bastante matemática (não, eu não era bom em matemática, e na verdade tinha uma dificuldade imensa com isso!), quando procurei estágio em um tal de Laboratório de Ecologia Quantitativa da UFV, que era coordenado pelo Prof Paulo De Marco Jr. O Paulo é um desses professores incríveis, que conseguem te convencer que qualquer assunto, por mais difícil que possa parecer, é a coisa mais legal do mundo. E aí começou a minha relação com a Estatística, que é uma ferramenta muito usada na Ecologia e que o Paulo domina e ensina com muita habilidade. Ali, no laboratório, eu fui tendo a chance de aprender um pouco do assunto de uma maneira bem legal: com aplicações, exemplos reais, coisas concretas. A forma de aprender ali não era tão baseada na matemática da coisa, e sim na forma de usar, o que me marcou muito. Comecei a sacar, então, que o contexto era muito importante para o aprendizados deste tipo de assunto: saber pra que serve, por que eu preciso usar e como vou usar na prátia fazia toda a diferença na hora de aprender!
Tá bom, agora vamos acelerar o filme, com cenas de todo mundo andando rápido e falando com voz fininha. Terminei a graduação, fiz mestrado, fiz doutorado. Ao longo deste tempo, eu fui, bem aos poucos, me adrentando cada vez mais no mundo da Estatística e suas aplicações na Biologia. Mais do que isso, fui tomando um gosto muito grande pelo desafio de ensinar este assunto! E aí, quando terminei o doutorado, vi uma vaga para concurso aqui na UFAL, na qual eles queriam justamente um biólogo que tivesse bom domínio de Estatística e Matematica aplicada à Biologia.
E aqui estamos! Quando comecei a minha disciplina de Bioestatística, comecei a criar, aos poucos, material para os meus alunos. E, de pouquinho em pouquinho, um pedaço deste material tomou a forma de uma apostila sobre o software R e suas aplicações na Bioestatística. Até que lá em março de 2015 a tal apostila chegou em sua versão final, que vocês ainda podem encontrar aqui se quiserem conhecer.
De lá pra cá, com a ajuda de vários alunos super empolgados aqui do Laboratório de Ecologia Quantitativa da UFAL, aconteceu uma campanha de financiamento coletivo, na qual nós levantamos recursos para equipar o nosso espaço com a promessa de produzir ciência e muito, mas muito, material didático. E aí chegamos aqui, nesta nova “apostila” que não é bem uma apostila. Você, leitor, que está conhecendo este material, deve se sentir imensamente grato, então, a um grupo enorme de pessoas que nos ajudaram a ter sucesso na nossa campanha, e que se tornaram, aos nossos olhos, Heróis da Ciência. :)
Beleza, então! O papo está bacana, mas é hora de seguirmos adiante e começar a falar do que interessa: Bioestatística e R. Nos vemos no próximo capítulo, certinho?
Abraços!
Este documento faz parte do material que disponibilizo no meu blog, o “Cantinho do R”, e foi foi criado utilizando o software R, o programa RStudio, a linguagem Markdown e o publicado com a ajuda do pacote Bookdown. Para saber mais sobre eles, acesse:
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