GitHub como herramienta de colaboraciĆ³n global en ciencia
2018-08-14
Preambulo
Quien soy?
Gabriel MuƱoz
Ciencias de la Biodiversidad
Ecologia Computacional
Consultor en Datos Biodiversidad y Geoespaciales
FVSE Coordinador de investigaciĆ³n
USFQ / UvA / Concordia
GitHub
Que es GitHub
Plataforma de colaboraciĆ³n en la creaciĆ³n de software
- Guardar, Compartir, Actualizar bases de datos y codigo.
- Tecnologia git (Transparencia, tiempo real)
Comprado por Microsoft (7.5 billons) :/
GitHub en Ciencia
Popular entre cientificos para colaborar en datos de investigaciĆ³n
- +250000 articulos citados
- Gratis (repositorio, codigo)
- Encontrar codigo! (85 Millones de repositorios - Junio 2018)
GitHub en Ciencia
- Desarrollar software cientifico
GitHub en Ciencia
- Citable, Encontrable y Abierto
DOI para cada repositorio (ZENODO, FIGSHARE)
Cuentas academicas (5 repositorios privados )
GitHub en Ciencia
Ciencia Reproducible
https://fgabriel1891.github.io/ManejoHabilDatosCharla/
GitHub en Ciencia
Documentacion
documentaciĆ³n de datos durante el proceso de anĆ”lisis
Preserva, Comparte, Reusa y Cita!
Taller practico
Crear una cuenta
Crear un repositorio
Un proyecto, una carpeta :)
Markdown, reportes reproducibles y GitHub
Maarkdown es un lenguaje simple, pero poderoso para crear publicaciones. Facil sintaxis que permite el formato y la inclusiĆ³n de links, imagenes, referencias, en el texto.
Ejemplos:
Primer example
Una ecuaciĆ³n: $A = \sin(x)^2*log(a)+25^{2}$
Esto es cĆ³digo this is code
A=sin(x)2ālog(a)+252
Segundo ejemplo
Una imagen: !(link a una imagen)
Tercer ejemplo:
hypervinculo: [GBIF](http://www.gbif.org/)
Este el es link a la pƔgina del GBIF.
Sintax general
Sweave & Reveal JS
Esta presentaciĆ³n fue hecha en Markdown
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Descubrir colaboradores y proyectos
Gracias!
Contacto
Gabriel MuƱoz
- fgabriel1891@gmail.com
- nasua.research@gmail.com
- 0960809080
- /fgabriel1891 (GitHub)
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