Quien soy?

Gabriel Muñoz

• Ciencias de la Biodiversidad

• Ecologia Computacional

Consultor en Datos Biodiversidad y Geoespaciales

FVSE Coordinador de investigación

USFQ / UvA / Concordia

Que es GitHub

https://github.com/

Plataforma de colaboración en la creación de software

• Guardar, Compartir, Actualizar bases de datos y codigo.
• Tecnologia git (Transparencia, tiempo real)

Comprado por Microsoft (7.5 billons) :/

GitHub en Ciencia

Popular entre cientificos para colaborar en datos de investigación

• +250000 articulos citados
• Gratis (repositorio, codigo)
• Encontrar codigo! (85 Millones de repositorios - Junio 2018)

GitHub en Ciencia

• Desarrollar software cientifico

Encontrar planetas

Analisis de DNA

R Open Science

GitHub en Ciencia

• Citable, Encontrable y Abierto

DOI para cada repositorio (ZENODO, FIGSHARE)

• Cuentas academicas (5 repositorios privados )

• Repositorios Academicos

GitHub en Ciencia

Ciencia Reproducible

https://fgabriel1891.github.io/ManejoHabilDatosCharla/

GitHub en Ciencia

Documentacion

documentación de datos durante el proceso de análisis

Preserva, Comparte, Reusa y Cita!

• ZENODO

• GitHub Personal favorite

• DataVerse

• FigShare

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Un proyecto, una carpeta :)

Markdown, reportes reproducibles y GitHub

Maarkdown es un lenguaje simple, pero poderoso para crear publicaciones. Facil sintaxis que permite el formato y la inclusión de links, imagenes, referencias, en el texto.

Ejemplos:

Primer example

Una ecuación: $A = \sin(x)^2*log(a)+25^{2}$

Esto es código this is code

\(A = \sin(x)^2*log(a)+25^{2}\)

Segundo ejemplo

Una imagen: !(link a una imagen)

Tercer ejemplo:

hypervinculo: [GBIF](http://www.gbif.org/)

Este el es link a la página del GBIF.

Sintax general

Sweave & Reveal JS

Esta presentación fue hecha en Markdown

Ejemplos

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Gracias!

Contacto

Gabriel Muñoz

• fgabriel1891@gmail.com
• nasua.research@gmail.com
• 0960809080
• /fgabriel1891 (GitHub)

Repositorio de esta presentación:

https://github.com/NASUA/GitHubMediaLabUIO